Selain menyediakan pengiriman jalur darat, cargo Jakarta Balikpapan juga dapat membantumengirimkan barang via laut. Biasanya pengiriman via laut ini dipilih oleh pebisnis yang hendak mengirimkan barang-barang berukuran besar kepada para pelanggannya. Alasan utama mengapa para pebisnis itu lebih menyukai menggunakan pengiriman jalur laut dikarenakan barang yang dikirim bisa lebih variatif.
